Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms