Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms