Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms