Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR31

SAR1A, GTP-binding protein SAR1a, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAR1AQ9NR31 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SAR1AQ9NR31 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SAR1AQ9NR31 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SAR1AQ9NR31 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SAR1AQ9NR31 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SAR1AQ9NR31 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SAR1AQ9NR31 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SAR1AQ9NR31 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAR1AQ9NR31 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAR1AQ9NR31 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAR1AQ9NR31 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAR1AQ9NR31 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAR1AQ9NR31 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAR1AQ9NR31 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAR1AQ9NR31 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAR1AQ9NR31 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAR1AQ9NR31 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAR1AQ9NR31 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAR1AQ9NR31 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAR1AQ9NR31 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAR1AQ9NR31 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAR1AQ9NR31 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAR1AQ9NR31 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAR1AQ9NR31 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAR1AQ9NR31 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAR1AQ9NR31 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAR1AQ9NR31 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAR1AQ9NR31 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAR1AQ9NR31 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAR1AQ9NR31 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAR1AQ9NR31 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAR1AQ9NR31 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAR1AQ9NR31 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAR1AQ9NR31 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAR1AQ9NR31 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAR1AQ9NR31 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAR1AQ9NR31 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAR1AQ9NR31 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAR1AQ9NR31 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAR1AQ9NR31 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAR1AQ9NR31 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAR1AQ9NR31 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAR1AQ9NR31 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAR1AQ9NR31 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAR1AQ9NR31 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SAR1AQ9NR31 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SAR1AQ9NR31 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAR1AQ9NR31 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SAR1AQ9NR31 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAR1AQ9NR31 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAR1AQ9NR31 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAR1AQ9NR31 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAR1AQ9NR31 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SAR1AQ9NR31 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SAR1AQ9NR31 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SAR1AQ9NR31 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SAR1AQ9NR31 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SAR1AQ9NR31 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SAR1AQ9NR31 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAR1AQ9NR31 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SAR1AQ9NR31 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SAR1AQ9NR31 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAR1AQ9NR31 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAR1AQ9NR31 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAR1AQ9NR31 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SAR1AQ9NR31 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SAR1AQ9NR31 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms