Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms