Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms