Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR8

KRTAP3-1, Keratin-associated protein 3-1, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP3-1Q9BYR8 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms