Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms