Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms