Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms