Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 AC010082.1-201ENST00000411797 546 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 RNF139-AS1-202ENST00000519861 359 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 AC020763.2-201ENST00000623155 1255 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms