Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms