Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms