Protein–RNA interactions for Protein: Q96LY2

CCDC74B, Coiled-coil domain-containing protein 74B, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74BQ96LY2 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC74BQ96LY2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC74BQ96LY2 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC74BQ96LY2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC74BQ96LY2 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC74BQ96LY2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC74BQ96LY2 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC74BQ96LY2 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC74BQ96LY2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC74BQ96LY2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC74BQ96LY2 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC74BQ96LY2 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC74BQ96LY2 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC74BQ96LY2 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC74BQ96LY2 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC74BQ96LY2 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC74BQ96LY2 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC74BQ96LY2 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC74BQ96LY2 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC74BQ96LY2 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC74BQ96LY2 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC74BQ96LY2 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC74BQ96LY2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC74BQ96LY2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC74BQ96LY2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC74BQ96LY2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC74BQ96LY2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC74BQ96LY2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC74BQ96LY2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC74BQ96LY2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC74BQ96LY2 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC74BQ96LY2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC74BQ96LY2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC74BQ96LY2 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC74BQ96LY2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC74BQ96LY2 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC74BQ96LY2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC74BQ96LY2 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC74BQ96LY2 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC74BQ96LY2 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC74BQ96LY2 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC74BQ96LY2 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC74BQ96LY2 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC74BQ96LY2 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC74BQ96LY2 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC74BQ96LY2 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC74BQ96LY2 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC74BQ96LY2 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC74BQ96LY2 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC74BQ96LY2 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC74BQ96LY2 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC74BQ96LY2 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC74BQ96LY2 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC74BQ96LY2 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC74BQ96LY2 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC74BQ96LY2 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC74BQ96LY2 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC74BQ96LY2 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC74BQ96LY2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC74BQ96LY2 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC74BQ96LY2 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC74BQ96LY2 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC74BQ96LY2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC74BQ96LY2 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC74BQ96LY2 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC74BQ96LY2 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC74BQ96LY2 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC74BQ96LY2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC74BQ96LY2 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC74BQ96LY2 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC74BQ96LY2 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC74BQ96LY2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms