Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms