Protein–RNA interactions for Protein: Q96H15

TIMD4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMD4Q96H15 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMD4Q96H15 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms