Protein–RNA interactions for Protein: Q92879

CELF1, CUGBP Elav-like family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF1Q92879 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms