Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
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RABGGTAQ92696 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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RABGGTAQ92696 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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RABGGTAQ92696 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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RABGGTAQ92696 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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RABGGTAQ92696 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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RABGGTAQ92696 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
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RABGGTAQ92696 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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