Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ69

C11orf40, Putative uncharacterized protein C11orf40, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf40Q8WZ69 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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C11orf40Q8WZ69 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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C11orf40Q8WZ69 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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C11orf40Q8WZ69 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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C11orf40Q8WZ69 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
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C11orf40Q8WZ69 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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C11orf40Q8WZ69 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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C11orf40Q8WZ69 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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C11orf40Q8WZ69 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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C11orf40Q8WZ69 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
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