Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI9

GATAD2B, Transcriptional repressor p66-beta, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2BQ8WXI9 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GATAD2BQ8WXI9 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms