Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC90

CCER1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER1Q8TC90 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCER1Q8TC90 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCER1Q8TC90 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCER1Q8TC90 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCER1Q8TC90 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCER1Q8TC90 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCER1Q8TC90 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCER1Q8TC90 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCER1Q8TC90 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CCER1Q8TC90 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCER1Q8TC90 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCER1Q8TC90 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCER1Q8TC90 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCER1Q8TC90 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCER1Q8TC90 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCER1Q8TC90 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCER1Q8TC90 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCER1Q8TC90 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCER1Q8TC90 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCER1Q8TC90 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCER1Q8TC90 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCER1Q8TC90 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCER1Q8TC90 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCER1Q8TC90 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCER1Q8TC90 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCER1Q8TC90 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CCER1Q8TC90 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCER1Q8TC90 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCER1Q8TC90 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCER1Q8TC90 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms