Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFJ8

BHLHE22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE22Q8NFJ8 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE22Q8NFJ8 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE22Q8NFJ8 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE22Q8NFJ8 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE22Q8NFJ8 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE22Q8NFJ8 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE22Q8NFJ8 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE22Q8NFJ8 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE22Q8NFJ8 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE22Q8NFJ8 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE22Q8NFJ8 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE22Q8NFJ8 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE22Q8NFJ8 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE22Q8NFJ8 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE22Q8NFJ8 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE22Q8NFJ8 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE22Q8NFJ8 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE22Q8NFJ8 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE22Q8NFJ8 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE22Q8NFJ8 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE22Q8NFJ8 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE22Q8NFJ8 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE22Q8NFJ8 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE22Q8NFJ8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE22Q8NFJ8 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE22Q8NFJ8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE22Q8NFJ8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE22Q8NFJ8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE22Q8NFJ8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE22Q8NFJ8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE22Q8NFJ8 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE22Q8NFJ8 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE22Q8NFJ8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE22Q8NFJ8 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE22Q8NFJ8 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
BHLHE22Q8NFJ8 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
BHLHE22Q8NFJ8 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
BHLHE22Q8NFJ8 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
BHLHE22Q8NFJ8 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
BHLHE22Q8NFJ8 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE22Q8NFJ8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE22Q8NFJ8 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE22Q8NFJ8 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE22Q8NFJ8 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE22Q8NFJ8 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE22Q8NFJ8 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE22Q8NFJ8 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE22Q8NFJ8 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE22Q8NFJ8 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE22Q8NFJ8 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE22Q8NFJ8 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE22Q8NFJ8 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE22Q8NFJ8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE22Q8NFJ8 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE22Q8NFJ8 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE22Q8NFJ8 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE22Q8NFJ8 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE22Q8NFJ8 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE22Q8NFJ8 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE22Q8NFJ8 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE22Q8NFJ8 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE22Q8NFJ8 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE22Q8NFJ8 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE22Q8NFJ8 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE22Q8NFJ8 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE22Q8NFJ8 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE22Q8NFJ8 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE22Q8NFJ8 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE22Q8NFJ8 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE22Q8NFJ8 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE22Q8NFJ8 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE22Q8NFJ8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE22Q8NFJ8 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE22Q8NFJ8 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE22Q8NFJ8 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE22Q8NFJ8 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE22Q8NFJ8 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE22Q8NFJ8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE22Q8NFJ8 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE22Q8NFJ8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE22Q8NFJ8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE22Q8NFJ8 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE22Q8NFJ8 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE22Q8NFJ8 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE22Q8NFJ8 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE22Q8NFJ8 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE22Q8NFJ8 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE22Q8NFJ8 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE22Q8NFJ8 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE22Q8NFJ8 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE22Q8NFJ8 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE22Q8NFJ8 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE22Q8NFJ8 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE22Q8NFJ8 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE22Q8NFJ8 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE22Q8NFJ8 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms