Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms