Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLF2Q8IX21 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLF2Q8IX21 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLF2Q8IX21 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLF2Q8IX21 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLF2Q8IX21 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLF2Q8IX21 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLF2Q8IX21 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms