Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB11FIP4Q86YS3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB11FIP4Q86YS3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB11FIP4Q86YS3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB11FIP4Q86YS3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB11FIP4Q86YS3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB11FIP4Q86YS3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB11FIP4Q86YS3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB11FIP4Q86YS3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
RAB11FIP4Q86YS3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAB11FIP4Q86YS3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAB11FIP4Q86YS3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAB11FIP4Q86YS3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
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RAB11FIP4Q86YS3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
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