Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT2

VPS37D, Vacuolar protein sorting-associated protein 37D, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37DQ86XT2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms