Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms