Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FOXD4L3Q6VB84 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FOXD4L3Q6VB84 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FOXD4L3Q6VB84 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FOXD4L3Q6VB84 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FOXD4L3Q6VB84 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FOXD4L3Q6VB84 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD4L3Q6VB84 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD4L3Q6VB84 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD4L3Q6VB84 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD4L3Q6VB84 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD4L3Q6VB84 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD4L3Q6VB84 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD4L3Q6VB84 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD4L3Q6VB84 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD4L3Q6VB84 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD4L3Q6VB84 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD4L3Q6VB84 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD4L3Q6VB84 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD4L3Q6VB84 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD4L3Q6VB84 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD4L3Q6VB84 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD4L3Q6VB84 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD4L3Q6VB84 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD4L3Q6VB84 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD4L3Q6VB84 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD4L3Q6VB84 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD4L3Q6VB84 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD4L3Q6VB84 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD4L3Q6VB84 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD4L3Q6VB84 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD4L3Q6VB84 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD4L3Q6VB84 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD4L3Q6VB84 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD4L3Q6VB84 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD4L3Q6VB84 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD4L3Q6VB84 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD4L3Q6VB84 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD4L3Q6VB84 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD4L3Q6VB84 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD4L3Q6VB84 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD4L3Q6VB84 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD4L3Q6VB84 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD4L3Q6VB84 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD4L3Q6VB84 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD4L3Q6VB84 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD4L3Q6VB84 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD4L3Q6VB84 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD4L3Q6VB84 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD4L3Q6VB84 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD4L3Q6VB84 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD4L3Q6VB84 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD4L3Q6VB84 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD4L3Q6VB84 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD4L3Q6VB84 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD4L3Q6VB84 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD4L3Q6VB84 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms