Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms