Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
INTS3Q68E01 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
INTS3Q68E01 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
INTS3Q68E01 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
INTS3Q68E01 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
INTS3Q68E01 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
INTS3Q68E01 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
INTS3Q68E01 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
INTS3Q68E01 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
INTS3Q68E01 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
INTS3Q68E01 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
INTS3Q68E01 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
INTS3Q68E01 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
INTS3Q68E01 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
INTS3Q68E01 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
INTS3Q68E01 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
INTS3Q68E01 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms