Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms