Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms