Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.1 ms