Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SVEP1Q4LDE5 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SVEP1Q4LDE5 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SVEP1Q4LDE5 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SVEP1Q4LDE5 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SVEP1Q4LDE5 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SVEP1Q4LDE5 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SVEP1Q4LDE5 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SVEP1Q4LDE5 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SVEP1Q4LDE5 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SVEP1Q4LDE5 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SVEP1Q4LDE5 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SVEP1Q4LDE5 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SVEP1Q4LDE5 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SVEP1Q4LDE5 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SVEP1Q4LDE5 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SVEP1Q4LDE5 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SVEP1Q4LDE5 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SVEP1Q4LDE5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SVEP1Q4LDE5 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SVEP1Q4LDE5 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SVEP1Q4LDE5 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SVEP1Q4LDE5 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SVEP1Q4LDE5 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SVEP1Q4LDE5 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SVEP1Q4LDE5 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SVEP1Q4LDE5 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SVEP1Q4LDE5 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SVEP1Q4LDE5 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SVEP1Q4LDE5 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SVEP1Q4LDE5 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SVEP1Q4LDE5 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SVEP1Q4LDE5 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SVEP1Q4LDE5 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SVEP1Q4LDE5 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SVEP1Q4LDE5 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SVEP1Q4LDE5 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SVEP1Q4LDE5 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SVEP1Q4LDE5 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SVEP1Q4LDE5 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SVEP1Q4LDE5 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SVEP1Q4LDE5 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SVEP1Q4LDE5 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SVEP1Q4LDE5 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SVEP1Q4LDE5 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SVEP1Q4LDE5 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SVEP1Q4LDE5 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SVEP1Q4LDE5 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SVEP1Q4LDE5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SVEP1Q4LDE5 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SVEP1Q4LDE5 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SVEP1Q4LDE5 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SVEP1Q4LDE5 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SVEP1Q4LDE5 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SVEP1Q4LDE5 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SVEP1Q4LDE5 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SVEP1Q4LDE5 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SVEP1Q4LDE5 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SVEP1Q4LDE5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SVEP1Q4LDE5 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SVEP1Q4LDE5 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SVEP1Q4LDE5 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SVEP1Q4LDE5 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SVEP1Q4LDE5 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVEP1Q4LDE5 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVEP1Q4LDE5 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVEP1Q4LDE5 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SVEP1Q4LDE5 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SVEP1Q4LDE5 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVEP1Q4LDE5 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms