Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms