Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7S5

SMIM21, Small integral membrane protein 21, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM21Q3B7S5 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM21Q3B7S5 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM21Q3B7S5 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM21Q3B7S5 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM21Q3B7S5 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM21Q3B7S5 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM21Q3B7S5 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM21Q3B7S5 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM21Q3B7S5 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM21Q3B7S5 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM21Q3B7S5 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM21Q3B7S5 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM21Q3B7S5 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM21Q3B7S5 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM21Q3B7S5 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM21Q3B7S5 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM21Q3B7S5 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM21Q3B7S5 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM21Q3B7S5 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM21Q3B7S5 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM21Q3B7S5 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM21Q3B7S5 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM21Q3B7S5 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM21Q3B7S5 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM21Q3B7S5 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM21Q3B7S5 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM21Q3B7S5 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM21Q3B7S5 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM21Q3B7S5 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM21Q3B7S5 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM21Q3B7S5 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM21Q3B7S5 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM21Q3B7S5 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM21Q3B7S5 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM21Q3B7S5 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM21Q3B7S5 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM21Q3B7S5 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM21Q3B7S5 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM21Q3B7S5 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM21Q3B7S5 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM21Q3B7S5 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM21Q3B7S5 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMIM21Q3B7S5 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMIM21Q3B7S5 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMIM21Q3B7S5 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMIM21Q3B7S5 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMIM21Q3B7S5 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMIM21Q3B7S5 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMIM21Q3B7S5 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM21Q3B7S5 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM21Q3B7S5 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM21Q3B7S5 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM21Q3B7S5 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM21Q3B7S5 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM21Q3B7S5 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM21Q3B7S5 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM21Q3B7S5 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM21Q3B7S5 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM21Q3B7S5 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM21Q3B7S5 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM21Q3B7S5 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM21Q3B7S5 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM21Q3B7S5 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM21Q3B7S5 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM21Q3B7S5 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM21Q3B7S5 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM21Q3B7S5 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM21Q3B7S5 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM21Q3B7S5 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM21Q3B7S5 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM21Q3B7S5 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM21Q3B7S5 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM21Q3B7S5 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM21Q3B7S5 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM21Q3B7S5 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM21Q3B7S5 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM21Q3B7S5 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM21Q3B7S5 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM21Q3B7S5 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM21Q3B7S5 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM21Q3B7S5 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM21Q3B7S5 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM21Q3B7S5 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM21Q3B7S5 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM21Q3B7S5 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM21Q3B7S5 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM21Q3B7S5 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM21Q3B7S5 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM21Q3B7S5 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM21Q3B7S5 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM21Q3B7S5 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM21Q3B7S5 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM21Q3B7S5 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM21Q3B7S5 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM21Q3B7S5 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM21Q3B7S5 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM21Q3B7S5 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM21Q3B7S5 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM21Q3B7S5 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM21Q3B7S5 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms