Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms