Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms