Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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