Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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