Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
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