Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms