Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
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