Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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