Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms