Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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