Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
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