Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
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UBE4AQ14139 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
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