Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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CAPSQ13938 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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CAPSQ13938 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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CAPSQ13938 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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CAPSQ13938 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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CAPSQ13938 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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CAPSQ13938 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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CAPSQ13938 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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CAPSQ13938 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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CAPSQ13938 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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