Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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CDH18Q13634 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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CDH18Q13634 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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CDH18Q13634 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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CDH18Q13634 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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